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杏彩体育官网:ProMass生物分子解卷积和报告软件

  当用电喷雾(ESI)离子化时,大的生物分子主要是多电荷的。当以正离子模式分析时,由于碱性氨基酸和

  当用电喷雾(ESI)离子化时,大的生物分子主要是多电荷的。当以正离子模式分析时,由于碱性氨基酸和氨基末端,肽或蛋白质将在多个位点质子化。另一方面,在负离子模式下分析的寡核苷酸由于酸性磷酸骨干而在多个位点去质子化。这种多次充电通常导致包含一系列电荷状态的ESI质谱。这些复杂的光谱必须“解卷积”或“转化”,以便确定生物分子的不带电荷的质量。 ProMass为执行整个LC / MS数据集的解卷积提供了一个自动化平台。

  ProMass从一开始就设计用于高通量应用。实际上,运行ProMass的正常方式是通过Xcalibur或MassLynx示例列表。因此,您可以运行样品列表,让ProMass在处理它们,或者在您方便的时候批量重新处理列表。

  ProMass使用称为ZNova的新型去卷积算法,可产生无伪像的解卷积质谱图。 ZNova可用于处理各种生物分子(包括蛋白质,寡核苷酸,肽等)的数据。与其他许多反卷积算法不同,ZNova可以适应低电荷状态谱和低信噪比的数据。 ProMass自动地以任何网页浏览器的易用和交互式格式报告结果。摘要页面汇总了多次运行的结果,并将其显示在单个超链接页面上,以便您快速浏览结果。目标质量特征允许您自动从LC / MS数据中搜索多个目标质量数。目标质量特征包括结果颜色编码,使您可以快速磨合可能需要进一步关注的样品。

  ProMass HR通过合并来自Positive Probability Ltd(PPL)的全套算法,包括用于高分辨率数据处理的其他功能。Promass HR方法可以利用PPL算法,该算法允许对同位素分辨的质谱进行单同位素质量测定或对同位素未分辨的质谱进行更高的分辨率。通过与Promass标准版本相同的强大机制,可以自动实现PPL方法。结果也通过相同的易于使用和直观的基于Wed的输出显示。

  ProMass不仅仅是解卷积软件。ProMass是一个工具,允许您以高度协作的基于Web的格式处理和传达您的结果。

  ProMass版本分为标准版和HR版本。ProMass HR版本包含标准版的所有功能,另外,HR版本还具备以下额外功能:

  ProMass HR包括标准的ProMass反褶积算法和Positive Probability Ltd(PPL)数据处理包

  PPL算法包括:去同位素(用于同位素分辨率质谱的单同位素质量测定)、峰值建模和形状反褶积,以及PPL电荷反褶积算法。

  PPL峰形反褶积可与质子电荷反褶积相结合,以提高电荷反褶积前生物分子(如Mab)质谱的分辨率。这可以做到与低分辨率的数据。

  ProMass HR可以引用ProMass参数文件,该文件嵌入了一个PPL方法来自动处理Xcalibur样本列表中的整个LCMS数据集。

  ProMass HR使用与标准的ProMass反褶积包相同的易于使用的基于web的界面输出结果。

  用户应该遵循安装计划使用的Xcalibur版本的一般系统要求。运行ProMass for Xcalibur的系统要求如下:

  注意: ProMass不包含Web服务器软件。如果要在本地计算机上查看结果,则不需要Web服务器。但是,如果您想通过Internet或Intranet与他人共享数据,则需要Web服务器。

  北京环中睿驰科技有限公司成立于2011年,代理国外正版学术科研软件,致力于为国内高校、科研院所、公司机构等,提供各行业的正版科学软件。帮助其完成学术论文发表配图、科研项目落地、以及公司项目实施。